More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5287 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 437 aa  895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  80.21 
 
 		 425 aa  614  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  79.26 
 
 		 399 aa  601  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  72.86 
 
 		 416 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  75.06 
 
 		 403 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  72.73 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  72.17 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  68.66 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  68.69 
 
 		 413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  62.4 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  57.28 
 
 		 436 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  57.85 
 
 		 381 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  59.14 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  57.78 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  60.32 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  57.82 
 
 		 385 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  55 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  55.61 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  56.2 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  37.3 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 425 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.95 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  38.14 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.81 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  36.62 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  38.77 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  34.85 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  36.32 
 
 		 380 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  35.13 
 
 		 369 aa  211  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  37.17 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  35.19 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.72 
 
 		 378 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  35.7 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.72 
 
 		 378 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  34.26 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  38.26 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  35.66 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  36.24 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 385 aa  207  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  36.53 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  32.67 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  35.73 
 
 		 365 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  34.75 
 
 		 421 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 384 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  36.32 
 
 		 354 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  35.22 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  33.07 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  35.64 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  36.1 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  35.75 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  36.49 
 
 		 577 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  36.53 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  35.12 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  35.88 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  34.04 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  36.44 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 834 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.21 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  34.05 
 
 		 364 aa  199  9e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.58 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  36.07 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  35.03 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  33.58 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  36.56 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  34.22 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  36.53 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 371 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  36.04 
 
 		 356 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.83 
 
 		 458 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  32.63 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  33.76 
 
 		 355 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  34.13 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  35.42 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  33.69 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 463 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  33.17 
 
 		 364 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  33.94 
 
 		 429 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  33.51 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  33.25 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  35.11 
 
 		 373 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  34.3 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 375 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  34.38 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  32.89 
 
 		 355 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  35.26 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  33.42 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>