More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3476 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 370 aa  736    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.64 
 
 		 466 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  40.72 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  38.48 
 
 		 387 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  38 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  39.52 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  39.46 
 
 		 419 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.36 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  38.08 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  39.15 
 
 		 393 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  39.02 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  38.53 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  38.83 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.35 
 
 		 425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  37.37 
 
 		 385 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  36.89 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  38.01 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  38.9 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  38.2 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  38.24 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 354 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  38.69 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.63 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  37.01 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  38.01 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  37.08 
 
 		 431 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  36.57 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  37.18 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  36.89 
 
 		 429 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 		 388 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  36.96 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  38.59 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  34.72 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  36.31 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  36.44 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  36.9 
 
 		 445 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  32.86 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  36.54 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  36.9 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.14 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.74 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  37.79 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  37.18 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  38.92 
 
 		 417 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  36.02 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.23 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  38.15 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  40.71 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  35.37 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  38.33 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  37.35 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  35.61 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  41.47 
 
 		 463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  36.34 
 
 		 429 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  36.5 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  38.55 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  38.05 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  34.76 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  39.46 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  35.43 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  35.76 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  36.44 
 
 		 399 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.19 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.1 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0418  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.1 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  36.96 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  38.11 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  35.64 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 		 420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  35.24 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  38.12 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.02 
 
 		 409 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  36.06 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  32.04 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  39.3 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  33.72 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  37.09 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.48 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  36.63 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  36.07 
 
 		 391 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  35.59 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>