More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3296 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  83.11 
 
 		 425 aa  634    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 399 aa  806    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  79.9 
 
 		 403 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  79.62 
 
 		 437 aa  601  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  75.6 
 
 		 416 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  72.28 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  74.27 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  69.9 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  72.03 
 
 		 422 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  63.13 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  58.58 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  58.12 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  56.81 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  59.14 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  57.07 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  55.65 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  56.03 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  52.82 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  53.48 
 
 		 385 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  38.65 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  38.31 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  39.01 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  36.22 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  35.46 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.7 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  36.92 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  36.41 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  33.77 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  37.11 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.67 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  35.64 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  32.26 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  35.92 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  35.03 
 
 		 412 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.05 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  35.39 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.08 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  33.59 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  34.32 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  36.06 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  35.34 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  37.34 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.39 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  37.17 
 
 		 448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.54 
 
 		 481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  35.9 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  35.98 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  35.22 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  33.96 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  36.51 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  33.16 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  33.6 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  35.94 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  35.2 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.85 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  35.44 
 
 		 355 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  35.06 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  37.04 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  34.01 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  35.08 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  35.2 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  35.2 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  35.37 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  33.95 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  37.63 
 
 		 392 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  32.71 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  32.72 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  34.95 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  34.86 
 
 		 423 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  34.95 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  30.79 
 
 		 360 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  34.49 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  33.95 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  34.67 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  34.58 
 
 		 376 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.83 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.01 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  34.46 
 
 		 834 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  30.81 
 
 		 345 aa  186  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  32 
 
 		 385 aa  186  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  35.86 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  32.75 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  35.79 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  33.16 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  34.31 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  32.55 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>