More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2765 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  100 
 
 		 367 aa  746    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  59.21 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  50.28 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  45.56 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 368 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  42.74 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  41.9 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  40.75 
 
 		 389 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  37.74 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.06 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.47 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  39.35 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  39 
 
 		 466 aa  238  9e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  37.4 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  37.93 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  37.93 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  37.75 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 		 481 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  38.9 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  38.29 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  38.79 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  37.05 
 
 		 408 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  39.41 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 419 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  36.62 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  37.75 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.51 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 410 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.96 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  38.6 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  36.74 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 		 430 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  37.98 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  37.36 
 
 		 414 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.81 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  36.78 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 		 413 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 407 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  37.39 
 
 		 391 aa  215  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  35.82 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  36.66 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  38.05 
 
 		 410 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  36.27 
 
 		 425 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0642  DNA-directed DNA polymerase  38.19 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  36.36 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  36.49 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  33.98 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  37.06 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  36.8 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  34.95 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  35.45 
 
 		 405 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  36.18 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  36.59 
 
 		 436 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  34.07 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.88 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.43 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  37.39 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  35 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.21 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  36.86 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  36.59 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  37.22 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  35.57 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  36.08 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  36.94 
 
 		 362 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  37.47 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  36.36 
 
 		 407 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  34.69 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  39.3 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  37.02 
 
 		 409 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  35.16 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  35.73 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  35.73 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  35.73 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  35.73 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  35.73 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  35.73 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  33.79 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  36.81 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  36.81 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>