More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3213 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 407 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  71.24 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  62.44 
 
 		 410 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  62.53 
 
 		 406 aa  454  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  61.23 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  61.42 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  56.49 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  59.54 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  58.13 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  57.87 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  58.46 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  55.09 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  53.89 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  57.4 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  57.88 
 
 		 419 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  54.34 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  54.24 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  54.73 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  52.82 
 
 		 414 aa  363  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  44.74 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  43.96 
 
 		 413 aa  290  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  49.56 
 
 		 418 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  49.56 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  48.99 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  47.16 
 
 		 409 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  43.57 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  44.7 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  48.25 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  46.21 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  46.13 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  47.44 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  51.48 
 
 		 413 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  46.09 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.47 
 
 		 384 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  45.6 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.12 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  44.13 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  44.7 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  44.7 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  42.17 
 
 		 428 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  41.47 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.83 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  39.42 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  43.67 
 
 		 424 aa  253  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  35.6 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  41.76 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  38.2 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  43.38 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.27 
 
 		 412 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  43.27 
 
 		 385 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  40.16 
 
 		 436 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.62 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  40.74 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  44.23 
 
 		 834 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  43.24 
 
 		 417 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  43.24 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  39.52 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  45.24 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.43 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  43.04 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  36.77 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  38.36 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  41.56 
 
 		 432 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  39.26 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  37.76 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  39.73 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  40.11 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  37.93 
 
 		 359 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  39.26 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  43.14 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  43.14 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  39.52 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  39.35 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  42.43 
 
 		 378 aa  240  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  39.63 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 429 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.77 
 
 		 363 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.72 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  44.12 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  40.63 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  38.28 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  39.1 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  43.01 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  38.99 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  39.15 
 
 		 431 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.82 
 
 		 466 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.92 
 
 		 409 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  44.38 
 
 		 417 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  37.54 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  38.3 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.8 
 
 		 422 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0243  ImpB/MucB/SamB family protein  40.2 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  37.4 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  41.53 
 
 		 363 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>