More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5890 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 409 aa  806    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  50.12 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  46.72 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  52.72 
 
 		 399 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  49.23 
 
 		 402 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  49.01 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  48.98 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  49.01 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  50.84 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  45.86 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  49.3 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  46 
 
 		 408 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  48.52 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  46.82 
 
 		 406 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.88 
 
 		 410 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  46.79 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  47.55 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  46.25 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  48.18 
 
 		 419 aa  292  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  47.16 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  48.33 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  44.81 
 
 		 408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  47.31 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  42.45 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  43.91 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  42.6 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.25 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  40.4 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  41.93 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  46.51 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  46.65 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  44.42 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  44.8 
 
 		 371 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  40.89 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  45.32 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  47.3 
 
 		 407 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  42.79 
 
 		 413 aa  275  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  39.59 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  41.04 
 
 		 397 aa  273  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 356 aa  272  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  43.64 
 
 		 407 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  43.64 
 
 		 407 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.05 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  43.14 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  42.97 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  43.28 
 
 		 424 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  44.16 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  38.86 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  38.85 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  40.7 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  41.76 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  46.29 
 
 		 466 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.78 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  47.24 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  42.15 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  41.9 
 
 		 359 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  49.16 
 
 		 415 aa  259  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 409 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  40.62 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  42.52 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  42.42 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  44.86 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  44.86 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  40.44 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  42.36 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  43.83 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  40.58 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  46.11 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  44.64 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  42.34 
 
 		 362 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  42.28 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  45.95 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  41.04 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 373 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  39.43 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 375 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  45.01 
 
 		 463 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  45.56 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.87 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  37.74 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  38 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  42.2 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  39.69 
 
 		 431 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  45.61 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  39.12 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  42.49 
 
 		 373 aa  246  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  42.12 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  39.78 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  42.12 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  42.75 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 834 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  42.12 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>