More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2961 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 356 aa  727    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  42.94 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.83 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 481 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  40.23 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.47 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  40.29 
 
 		 378 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.77 
 
 		 363 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  38.79 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  37.75 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  38.17 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  39.41 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  37.36 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  36.21 
 
 		 374 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  37.69 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  37.28 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  38.67 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  35.23 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  36.2 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  34.2 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  34.2 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.4 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  35.91 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  39.18 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  35.59 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  38.98 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  34.18 
 
 		 466 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  37.75 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  35.55 
 
 		 417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  35.55 
 
 		 449 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  36.69 
 
 		 356 aa  215  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  35.82 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  36.69 
 
 		 356 aa  215  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  40.17 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  34.97 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  35.12 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  34.71 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  33.81 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  37.75 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.9 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  34.87 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  35.67 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  35 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 359 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  37.33 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  34.32 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.52 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  36.95 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  36.47 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  33.33 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  34.27 
 
 		 443 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 406 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  34.72 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  37.35 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  34.32 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  34.9 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  33.43 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  35.38 
 
 		 431 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  32.95 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  35.65 
 
 		 354 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  35.07 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 417 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.15 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  33.83 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  33.43 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  33.82 
 
 		 351 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  33.82 
 
 		 351 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  32.84 
 
 		 453 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  33.82 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  35.57 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  35.99 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  34.87 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  33.82 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  34.17 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  31.93 
 
 		 429 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  33.53 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  33.72 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  35.61 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  32.55 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  35.38 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  31.7 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  35.03 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  32.06 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  34.8 
 
 		 431 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>