More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0362 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  90.88 
 
 
351 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  90.88 
 
 
351 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  90.6 
 
 
351 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  90.03 
 
 
351 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  87.5 
 
 
352 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  100 
 
 
351 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  90.6 
 
 
351 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  90.83 
 
 
354 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  100 
 
 
351 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  90.31 
 
 
351 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  99.43 
 
 
351 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  99.72 
 
 
351 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  90.88 
 
 
351 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  99.43 
 
 
351 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  90.88 
 
 
351 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  76.79 
 
 
352 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  79.71 
 
 
353 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  75.93 
 
 
352 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  77.08 
 
 
352 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  77.08 
 
 
352 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  76.79 
 
 
352 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  73.35 
 
 
352 aa  527  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0894  DNA polymerase IV  71.92 
 
 
352 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  62.11 
 
 
356 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  59.77 
 
 
372 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  61.24 
 
 
359 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  61.54 
 
 
358 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  58.84 
 
 
358 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  60.41 
 
 
360 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  58.91 
 
 
356 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  58.84 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  59.17 
 
 
364 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  58.29 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  58.01 
 
 
358 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  59.83 
 
 
379 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  57.97 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  57.38 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  58.38 
 
 
357 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00753  DNA polymerase IV  58.96 
 
 
349 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  58.02 
 
 
359 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  57.27 
 
 
350 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  64.09 
 
 
304 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  58.19 
 
 
359 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  57.89 
 
 
359 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  57.6 
 
 
359 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  56.34 
 
 
355 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  56.21 
 
 
359 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  55.59 
 
 
353 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1040  DNA polymerase IV  54.13 
 
 
352 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  52.65 
 
 
355 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  52.65 
 
 
355 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  49.42 
 
 
352 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  50.44 
 
 
353 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  49.57 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  48.97 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  50.29 
 
 
353 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  47.4 
 
 
405 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  49 
 
 
348 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  49.71 
 
 
354 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  47.11 
 
 
379 aa  315  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  52.15 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  49.41 
 
 
354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  49.42 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  50 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  49.41 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  47.4 
 
 
407 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  47.11 
 
 
383 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  47.11 
 
 
408 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  49.12 
 
 
354 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  46.57 
 
 
392 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  47.11 
 
 
361 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  48.53 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  48.68 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  46.82 
 
 
429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  44.64 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  47.04 
 
 
362 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  46.76 
 
 
357 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  46.47 
 
 
357 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  46.57 
 
 
403 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  46.29 
 
 
404 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  46.29 
 
 
406 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  46.29 
 
 
400 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  46.29 
 
 
404 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  46.29 
 
 
400 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  46.29 
 
 
400 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  48.97 
 
 
364 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  46.92 
 
 
371 aa  289  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  45.01 
 
 
381 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  45.16 
 
 
372 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  44.85 
 
 
363 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  46.87 
 
 
353 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  42.09 
 
 
360 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  44.19 
 
 
359 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  40.85 
 
 
359 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  45.38 
 
 
354 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  45.9 
 
 
365 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  47.39 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 
359 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  44.8 
 
 
378 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  47.06 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>