More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1272 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 359 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  63.79 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  65.49 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  61.65 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  65.09 
 
 		 381 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  62.32 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  61.95 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  60.87 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  61.92 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  58.64 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  62.15 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  58.89 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  58.88 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  57.51 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  57.18 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  56.51 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  53.91 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  53.18 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  53.63 
 
 		 371 aa  362  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  55.13 
 
 		 376 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1442  DNA polymerase IV (Pol IV 3)  53.26 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  55.39 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  53.18 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  51.01 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  53.01 
 
 		 353 aa  338  7e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  52.37 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  53.82 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  51.59 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  47.62 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  52.92 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  49.56 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.67 
 
 		 378 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.67 
 
 		 378 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  46.07 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  51.92 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  44.48 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  49.14 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  51.97 
 
 		 352 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  48.68 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  48.38 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3809  DNA-directed DNA polymerase  71.57 
 
 		 412 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  51.49 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  58.98 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  45.38 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  48.24 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  47.04 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  46.75 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  46.75 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  51.34 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  51.34 
 
 		 354 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  46.43 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  45.45 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  45.45 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  47.83 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  45.03 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  44.82 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  48.67 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  47.65 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  46.39 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  50.67 
 
 		 354 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  45.75 
 
 		 407 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  48.25 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  44.69 
 
 		 379 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  50.5 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  48.08 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  45.72 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  47.94 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  44.35 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  48.03 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  45.24 
 
 		 352 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  48.69 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  46.8 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  46.22 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  44.88 
 
 		 392 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  44.16 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  48.4 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  43.87 
 
 		 357 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  48.4 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 404 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  48.16 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 406 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 404 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  47.81 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  44.25 
 
 		 350 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  44.48 
 
 		 351 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  44.54 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  44.48 
 
 		 351 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  46.45 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  43.7 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  46.72 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  44.32 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  43.6 
 
 		 351 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  46.72 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  46.72 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>