More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2097 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 373 aa  761    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  69.86 
 
 		 359 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  68.66 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  69.41 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  67.34 
 
 		 363 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  65.53 
 
 		 354 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  63.56 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  64.49 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  64.71 
 
 		 381 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  61.82 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  62.15 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  61.13 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  58.92 
 
 		 380 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  63.02 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  61.47 
 
 		 375 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  59.17 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  57.31 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1442  DNA polymerase IV (Pol IV 3)  55.46 
 
 		 330 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  54.7 
 
 		 371 aa  355  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  51.82 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  54.6 
 
 		 372 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  54.25 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  54.49 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  51.74 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  54.72 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  52.02 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  50.68 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  48.2 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  48.2 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3809  DNA-directed DNA polymerase  74.52 
 
 		 412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  51.12 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  51 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  52.03 
 
 		 369 aa  318  7e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  51.18 
 
 		 353 aa  318  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  46.76 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  49.03 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  47.61 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  50.86 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  48.86 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  49.71 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  48.67 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  47.12 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  46.7 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  46.01 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  48.67 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  48.56 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  45.63 
 
 		 361 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  45.63 
 
 		 408 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  45.63 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  47.35 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  47.35 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  47.35 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  49.26 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  49.56 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  47.59 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  49.26 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  46.8 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  47.06 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  44.57 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  47.63 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  46.22 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  48.45 
 
 		 364 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  47.2 
 
 		 358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  47.2 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  45.33 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  44.72 
 
 		 352 aa  285  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  42.77 
 
 		 367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  50 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  46.54 
 
 		 404 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  46.81 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  46.54 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  46.54 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  46.54 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  46.54 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  46.54 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  49.18 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  50.17 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  47.06 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  49.5 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  44.85 
 
 		 351 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  46.76 
 
 		 355 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  44.85 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  49.33 
 
 		 357 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 351 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  47.76 
 
 		 348 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  49.5 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  44.85 
 
 		 351 aa  275  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 		 358 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  49.83 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 351 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  44.57 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  44.04 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>