More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0662 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 353 aa  723    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  67.81 
 
 		 360 aa  478  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  68.93 
 
 		 368 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  54.26 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  55.19 
 
 		 372 aa  345  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  55.03 
 
 		 354 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  55.59 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  53.01 
 
 		 359 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  54.98 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  53.01 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  53.49 
 
 		 371 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  49.43 
 
 		 359 aa  332  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  52.37 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  52.87 
 
 		 378 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  50.44 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  52.05 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  49.86 
 
 		 380 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  54.03 
 
 		 358 aa  318  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  49.85 
 
 		 373 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  50.45 
 
 		 359 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  49.25 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  47.59 
 
 		 360 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  47.9 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  50.76 
 
 		 376 aa  305  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  49.85 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  50.6 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  51.18 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  50.45 
 
 		 374 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  48.49 
 
 		 381 aa  301  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  47.49 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  47.49 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  47.9 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  48.1 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  46.9 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  46.9 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  43.15 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  43.97 
 
 		 369 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  47.66 
 
 		 369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  45 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  45.35 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 359 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  45.78 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  43.64 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  44.35 
 
 		 364 aa  265  5.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  42.51 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  46.55 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  43.54 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  43.9 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  44.71 
 
 		 389 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  42.69 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  42.69 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  44.76 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  45.4 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  44.21 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  42.69 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  42.32 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  44.48 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  46.31 
 
 		 356 aa  258  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  42.4 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  42.4 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1442  DNA polymerase IV (Pol IV 3)  44.67 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  43.39 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  43.27 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  45.65 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  43.54 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  43.31 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  43.31 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  43.27 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  44.11 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  45.45 
 
 		 364 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  44.28 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  45.81 
 
 		 358 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  41.12 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  43.33 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  45.81 
 
 		 358 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  43.02 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  43.71 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  42.77 
 
 		 481 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  45.81 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  43.87 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 418 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  45.51 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  43.33 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  43.33 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  41.5 
 
 		 352 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  43.03 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  43.33 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  41.02 
 
 		 386 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  43.92 
 
 		 359 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  41.45 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  41.76 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 353 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>