More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0418 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0418  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  100 
 
 		 373 aa  765    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  44.66 
 
 		 364 aa  297  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  43.37 
 
 		 367 aa  292  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  41.87 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  40.06 
 
 		 361 aa  259  7e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  41.8 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  40.44 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  41.55 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  40 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.87 
 
 		 371 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  39.3 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  40.87 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  38.87 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  39.62 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  38.95 
 
 		 356 aa  236  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  38.95 
 
 		 356 aa  236  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  40.69 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  40.28 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  39.48 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  39.61 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  38.68 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  44.01 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  38.8 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  40.25 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 410 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  40.4 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  40.35 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  39.28 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  38.87 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  39.61 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  38.94 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  37.5 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  38.79 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  39.74 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  38.78 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  37.43 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  36.78 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  38.55 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  36.96 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  38.04 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  37.36 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  36.89 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  36.89 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  35.92 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  36.6 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  36.02 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  37.85 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  36.64 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  36.6 
 
 		 351 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  38.4 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  37.25 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  37.29 
 
 		 385 aa  215  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  36.6 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  36.6 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  37.94 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  38.11 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  44.06 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  40.17 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  37.46 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  38.51 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  37.46 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  37.46 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  37.46 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  37.46 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  37.46 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  37.07 
 
 		 436 aa  212  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  43.3 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  35.94 
 
 		 384 aa  212  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  37.46 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  36.36 
 
 		 356 aa  212  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  36.84 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  37.36 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  37.99 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0894  DNA polymerase IV  37.54 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  37.57 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  37.28 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  35.34 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  36.56 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  35.34 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  37.28 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  35.34 
 
 		 359 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  36.39 
 
 		 453 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.24 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  38.57 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  36.29 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  36.75 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  35.92 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  36.9 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  40.65 
 
 		 353 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  42.91 
 
 		 369 aa  205  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>