More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0076 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 577 aa  1098    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  57.75 
 
 		 489 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  47.73 
 
 		 834 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  49.37 
 
 		 458 aa  287  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  52.14 
 
 		 463 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  46.24 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  43.94 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  49.83 
 
 		 378 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  49.83 
 
 		 378 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  41.53 
 
 		 363 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  49.86 
 
 		 443 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  44.28 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  44.78 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  46.92 
 
 		 356 aa  253  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  51.42 
 
 		 448 aa  253  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  44.71 
 
 		 380 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 418 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  39.6 
 
 		 389 aa  252  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  41.86 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  45.71 
 
 		 424 aa  249  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.4 
 
 		 418 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  45.4 
 
 		 418 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  48.16 
 
 		 374 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  47.35 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.6 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  41.89 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  42.14 
 
 		 378 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  41.24 
 
 		 378 aa  243  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  45.39 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  44.67 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 369 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  44.94 
 
 		 454 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.35 
 
 		 419 aa  240  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  41.62 
 
 		 381 aa  240  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  43.44 
 
 		 363 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  45.14 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  45.81 
 
 		 402 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  41.34 
 
 		 375 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 360 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  44.99 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.78 
 
 		 415 aa  233  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  41.83 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  38.98 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 386 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  41.86 
 
 		 360 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  42.73 
 
 		 369 aa  230  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 		 373 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 		 381 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  42.28 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.88 
 
 		 393 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40.43 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  44.63 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 356 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  44.99 
 
 		 466 aa  227  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 		 353 aa  226  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  43.79 
 
 		 406 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  46.65 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 348 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  44.26 
 
 		 420 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  41.69 
 
 		 417 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  37.57 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  38.8 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.18 
 
 		 384 aa  223  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 		 409 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  37.3 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  41.69 
 
 		 449 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  38.12 
 
 		 371 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  41.25 
 
 		 383 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  41.25 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  34.71 
 
 		 359 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  41.25 
 
 		 361 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  37.32 
 
 		 357 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 407 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  38.83 
 
 		 359 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  36.76 
 
 		 356 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  36.76 
 
 		 356 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  36.86 
 
 		 408 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  41.06 
 
 		 417 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  40.34 
 
 		 392 aa  220  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  44.16 
 
 		 413 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  41.3 
 
 		 376 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  45.66 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 		 422 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  37.06 
 
 		 409 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  35.88 
 
 		 356 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.26 
 
 		 412 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  35.54 
 
 		 359 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 		 385 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  38.74 
 
 		 395 aa  216  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.95 
 
 		 358 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  45.66 
 
 		 407 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  45.66 
 
 		 407 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>