More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5822 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  100 
 
 		 353 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  58.54 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  60.12 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  57.48 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3067  DNA polymerase IV  57.23 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1036  DNA polymerase IV  58.41 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  54.3 
 
 		 357 aa  362  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  54.09 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1793  DNA polymerase IV  55.13 
 
 		 355 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal  0.997558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1812  DNA polymerase IV  55.13 
 
 		 355 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1859  DNA polymerase IV  55.13 
 
 		 355 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  51.31 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0489  DNA polymerase IV  52.68 
 
 		 344 aa  335  7e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1153  DNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  33.23 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  41.43 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.15 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 430 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  38.05 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  40.88 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  39 
 
 		 466 aa  205  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  32.49 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  38.26 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 424 aa  202  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.39 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  40.59 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  39 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  38.05 
 
 		 390 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  37.54 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.64 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  38.23 
 
 		 436 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  33.73 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.9 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  35.69 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  37.54 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  34.78 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  39.94 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.91 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  36.94 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.09 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.2 
 
 		 409 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  38.74 
 
 		 385 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.64 
 
 		 415 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  37.54 
 
 		 363 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 354 aa  192  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  36.2 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 355 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  39.05 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  35.47 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  39.24 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  32.46 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  31.86 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  32.27 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  38.9 
 
 		 415 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  37.46 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  38.42 
 
 		 407 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  38.78 
 
 		 399 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  34.4 
 
 		 425 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  33.06 
 
 		 416 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  37.46 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  34.47 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 418 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  36.89 
 
 		 834 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  32.25 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  36.89 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  34.33 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 437 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  35.8 
 
 		 417 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  32.09 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  39.12 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  35.91 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  37.94 
 
 		 430 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  33.62 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  33.06 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  36.1 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  33.15 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  31.69 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  33.92 
 
 		 413 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>