More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3489 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 394 aa  758    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  60.12 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  58.09 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  54.29 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0489  DNA polymerase IV  55.92 
 
 		 344 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  53.49 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3067  DNA polymerase IV  53.89 
 
 		 351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  52.35 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  51.31 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1793  DNA polymerase IV  52.57 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal  0.997558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1812  DNA polymerase IV  52.57 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1859  DNA polymerase IV  52.57 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1036  DNA polymerase IV  54.01 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1153  DNA-directed DNA polymerase  45.71 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  42.61 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  42.18 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  41.89 
 
 		 419 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  37.27 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.86 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.42 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  35.65 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  36.58 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  36.7 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  35.67 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  41.95 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.69 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  41.21 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  39.54 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  36.26 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  40.92 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  37.63 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  33.97 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  37.72 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  34.9 
 
 		 354 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 415 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.4 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  36.76 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.41 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  34.2 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.83 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.24 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  30.73 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  30.59 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  39.35 
 
 		 466 aa  186  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.51 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  34.75 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  35.99 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  38.29 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  37.19 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  34.9 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  34.9 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  38.94 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  40.36 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  39.03 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.07 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  37.36 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  36.64 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  32.65 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  32.94 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 437 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  36.47 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  36.93 
 
 		 834 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  36.7 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  35.95 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  32.54 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  38.01 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  35.9 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 		 444 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  34.19 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  34.39 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.61 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  34.28 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.61 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  37.68 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  33.62 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  36.36 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>