More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  100 
 
 		 414 aa  818    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  61.1 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  57.39 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  55.19 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  54.38 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  53.87 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  54.97 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  53.95 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  52.56 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  54.64 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  53.13 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  52.91 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  53.88 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  53.73 
 
 		 415 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  51.72 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  52.32 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  52.21 
 
 		 407 aa  358  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  52.69 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  49.62 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  47.3 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  41.42 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  46.78 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  44.91 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  40.73 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  43.59 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  46.8 
 
 		 409 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.56 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 355 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  40.93 
 
 		 391 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.32 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  45.32 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  38.18 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 399 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  42.09 
 
 		 407 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.9 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  40.1 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  45.32 
 
 		 418 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  44.69 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  45.66 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  45.66 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  38.73 
 
 		 359 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  43.63 
 
 		 380 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  44.06 
 
 		 385 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  43.11 
 
 		 405 aa  259  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  43.73 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  41.34 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  39.58 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  42.07 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  42.65 
 
 		 354 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.63 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  42.97 
 
 		 419 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  39.23 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  40.1 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.18 
 
 		 412 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  43.59 
 
 		 424 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0243  ImpB/MucB/SamB family protein  36.14 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  42.15 
 
 		 375 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  41.34 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  42.71 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  43.06 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  43.22 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  43.22 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  40.77 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  41.25 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  38.12 
 
 		 409 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  41.84 
 
 		 435 aa  246  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  37.76 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  41.14 
 
 		 378 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  43.73 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  40.05 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 385 aa  242  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.91 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  40.17 
 
 		 834 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  37.72 
 
 		 358 aa  240  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  40.71 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 372 aa  239  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  37.73 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  38.44 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 481 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.82 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  40.67 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  41.27 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  39.64 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  37.24 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.73 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  38.76 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  39.38 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  37.01 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  41.87 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  37.76 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  37.85 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  38.6 
 
 		 431 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  37.85 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>