More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5685 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  87.94 
 
 		 413 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  100 
 
 		 424 aa  832    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  84.56 
 
 		 407 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  85.29 
 
 		 407 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  85.29 
 
 		 407 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  64.41 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  64.32 
 
 		 402 aa  478  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  66.25 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  60.3 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  60.55 
 
 		 405 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0380  DNA-directed DNA polymerase  56 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154021  decreased coverage  0.00759765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  49.11 
 
 		 421 aa  319  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  47.69 
 
 		 428 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.25 
 
 		 415 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  45.06 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  41.75 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  43.52 
 
 		 415 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.05 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  43.88 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  46.51 
 
 		 419 aa  259  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  44.77 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  43.1 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.64 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  45.9 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  43.56 
 
 		 410 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  43.62 
 
 		 430 aa  256  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  43.88 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.36 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  42.36 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.59 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  45.65 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.15 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.24 
 
 		 384 aa  249  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  45.6 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  43.08 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  43.08 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  38.97 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  41.69 
 
 		 834 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  42.05 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  40.84 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  36.27 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 466 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  37.98 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  35.86 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.56 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  33.93 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  40.28 
 
 		 374 aa  236  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  39.01 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  39.07 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.44 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  39.5 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  40.15 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.37 
 
 		 407 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  41.6 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  38.57 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  41.6 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  41.6 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  38.31 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  38.31 
 
 		 449 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.71 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  35.69 
 
 		 358 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  37.56 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.53 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  38.46 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  41.59 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.91 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  36.21 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 395 aa  226  9e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  39.04 
 
 		 354 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  35.36 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  36.25 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.52 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  38.04 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  35.47 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  41.72 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  33.72 
 
 		 359 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.29 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  36.82 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  33.81 
 
 		 389 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  37.22 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  36.06 
 
 		 445 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.24 
 
 		 359 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  35.63 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  40.98 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 353 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  36.07 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>