More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1122 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  100 
 
 		 413 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  87.94 
 
 		 424 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  82.08 
 
 		 407 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  82.08 
 
 		 407 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  81.11 
 
 		 407 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  66.17 
 
 		 401 aa  481  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  63.25 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  61.31 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  58.15 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  58.29 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  47.7 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0380  DNA-directed DNA polymerase  56.29 
 
 		 358 aa  318  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154021  decreased coverage  0.00759765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  49.11 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  46.45 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  44.39 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.79 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.03 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  43.41 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  41.65 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  43.03 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  45.09 
 
 		 419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  43.8 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  43.37 
 
 		 415 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  43.58 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  43.37 
 
 		 430 aa  252  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.82 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  42.54 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  42.93 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.93 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  43.82 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  42.93 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  44 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  44 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  44.78 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.76 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  41.77 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  41.31 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  42.45 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  41.73 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  41.04 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  38.72 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  34.84 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  40.39 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  44.48 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  43.3 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  46.01 
 
 		 407 aa  237  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.27 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.54 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 834 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  34.46 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 413 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.75 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  37.04 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.34 
 
 		 372 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  39.54 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.15 
 
 		 409 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  34.08 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  38.78 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  32.66 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  41.03 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  38.61 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.44 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  38 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  36.55 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  39.18 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  38.59 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  33.81 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  34.68 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  41.14 
 
 		 353 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 386 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  37.71 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  38.57 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  34.98 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  36.79 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  36.57 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.43 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  32.17 
 
 		 359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  40.74 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  36.53 
 
 		 417 aa  220  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  39.72 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  35.1 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  33.14 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  40.8 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  41.67 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  39.72 
 
 		 354 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  36.87 
 
 		 417 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  39.44 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  40 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  37.86 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  39.72 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>