More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  100 
 
 		 422 aa  816    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.8 
 
 		 410 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  45.28 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  46.5 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  45.25 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  44.95 
 
 		 424 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.6 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  43.2 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.73 
 
 		 417 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  45.32 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 		 420 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  43.7 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.37 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.2 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  43.41 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.02 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  42.64 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  40.91 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 384 aa  249  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 		 407 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.11 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  34.73 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.31 
 
 		 414 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.01 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  41 
 
 		 421 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 397 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  44.21 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  39.6 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.27 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  40.99 
 
 		 407 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  39.02 
 
 		 395 aa  230  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.82 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  41.41 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  37.63 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  43.82 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  35.94 
 
 		 391 aa  227  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  45.54 
 
 		 418 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.57 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.16 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  39.66 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  36.36 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  38.74 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  38.74 
 
 		 449 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.7 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  40.35 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  39.14 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  39.02 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  39.8 
 
 		 407 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  33.16 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  41.83 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  34.41 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  38.66 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  43.18 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  33.42 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  38.99 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  42.77 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  39.88 
 
 		 481 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  40.58 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  40.05 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  40.05 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.35 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  39.02 
 
 		 402 aa  217  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  35.14 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  40.51 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0243  ImpB/MucB/SamB family protein  33.61 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  41.14 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.45 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  41.14 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  36.55 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  33.78 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  37.09 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  34.91 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  31.7 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  36.32 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  34.37 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  37.39 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  39.01 
 
 		 409 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  34.37 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0418  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  36.71 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.9 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  37.43 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  36.92 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  33.16 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  34.1 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  34.1 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  37.57 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  33.16 
 
 		 393 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  36.57 
 
 		 365 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>