More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3115 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  79.1 
 
 		 453 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  77.38 
 
 		 455 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  98.89 
 
 		 454 aa  874    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  100 
 
 		 452 aa  883    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  99.12 
 
 		 452 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  75.9 
 
 		 463 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  67.57 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  64.25 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.02 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.73 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  46.28 
 
 		 463 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  44.29 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 834 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.7 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  45.39 
 
 		 577 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.73 
 
 		 424 aa  235  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  43.94 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.66 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 		 417 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  43.7 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  40.41 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  37.71 
 
 		 371 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  42.17 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 		 410 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  37.78 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  38.53 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  41.78 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  42.03 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  40.88 
 
 		 356 aa  210  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  41.41 
 
 		 399 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  41.69 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.11 
 
 		 415 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  40.83 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  43.56 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  40.35 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  37.75 
 
 		 372 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  37.6 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.66 
 
 		 399 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  41.8 
 
 		 402 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  36.83 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  40.12 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  40.51 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  34.77 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  39.3 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  38.27 
 
 		 365 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 409 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  34.58 
 
 		 354 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  38.76 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.29 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  40.11 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  38.16 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  35.89 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  41.71 
 
 		 355 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  39.24 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 422 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  38.53 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  39.66 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  39.66 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  33.71 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40.53 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  41.16 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  42.27 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  40.17 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  40.29 
 
 		 369 aa  193  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  40.29 
 
 		 407 aa  193  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  41.29 
 
 		 431 aa  193  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  41.31 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  41.35 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  38.86 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  41.99 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  39.2 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.68 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  37.79 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  39.39 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  36.94 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  37.85 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  39 
 
 		 481 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  38.07 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  38.01 
 
 		 445 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  41.23 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  37.72 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.94 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  39.88 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  38.01 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  37.17 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  41.67 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>