More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3642 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  100 
 
 		 455 aa  898    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  77.38 
 
 		 452 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  77.36 
 
 		 454 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  77.65 
 
 		 452 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  79.87 
 
 		 453 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  73.15 
 
 		 463 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  66.3 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  65.99 
 
 		 449 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.03 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.37 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  46.26 
 
 		 463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  45.24 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  43.31 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  40.83 
 
 		 834 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.83 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.66 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  45.38 
 
 		 418 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  45.76 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.57 
 
 		 424 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  42.33 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.48 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  43.99 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  37.75 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.77 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  39.69 
 
 		 410 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  43.84 
 
 		 577 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  41.46 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  40.55 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.19 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 406 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  40.7 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.96 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  36.78 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.39 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 384 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  37.25 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  38.44 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.24 
 
 		 399 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 412 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  36.64 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  39.15 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  40.64 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  40.88 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  43.57 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  39.36 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  37.88 
 
 		 365 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 402 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  39.88 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  38 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  39.61 
 
 		 369 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  41.04 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  42.03 
 
 		 430 aa  196  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  35.24 
 
 		 354 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  38.95 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  38.24 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  41.5 
 
 		 362 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.11 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  34.35 
 
 		 358 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  37.72 
 
 		 417 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  39.14 
 
 		 408 aa  193  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  38.29 
 
 		 421 aa  193  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  40.35 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  39.02 
 
 		 380 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  41.5 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  32.68 
 
 		 360 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  39 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.68 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34 
 
 		 409 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  38.97 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  39.48 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  38.78 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  38.55 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  37.54 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  39.42 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  37.68 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  36.21 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  37.07 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  36.49 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.48 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  37.79 
 
 		 445 aa  187  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  38.71 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  41.03 
 
 		 407 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  36.09 
 
 		 428 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  36.68 
 
 		 368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  37.79 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  40.38 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.15 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.74 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  36.03 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>