More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2282 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2282  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 424 aa  878    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0665124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3025  DNA-directed DNA polymerase  35.08 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.0754009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0324  DNA-directed DNA polymerase  32.62 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0305  DNA-directed DNA polymerase  33.41 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  28.17 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5590  DNA-directed DNA polymerase  37.28 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  29.55 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  29.76 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  28.67 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  28.5 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  28.54 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  28.47 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  27.75 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  25.69 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  29.85 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  28.71 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  32.64 
 
 		 368 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  28.88 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.48 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  28.91 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  27.64 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  25.12 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  25.96 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 		 397 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  25.88 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  28.43 
 
 		 411 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  28.45 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  27.91 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  25.52 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  27.6 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  28.68 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  26.97 
 
 		 399 aa  99.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  25.13 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  25.84 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0894  DNA polymerase IV  28.18 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  28.18 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  28.74 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  25.63 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  25.63 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  25.63 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  25.63 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  27.38 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  25.63 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  25.68 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  31.62 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  33.82 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  25.38 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  32.08 
 
 		 360 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  25.38 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  26.67 
 
 		 356 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0483  DNA polymerase family protein  23.9 
 
 		 360 aa  96.7  8e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0359018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  25.38 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  27.27 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  29.33 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  28.69 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  24.21 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  29.21 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  27.18 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  33.48 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  30.14 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  26.37 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  27.84 
 
 		 356 aa  94.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  28.12 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.43 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  25.31 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  28.05 
 
 		 407 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  28.35 
 
 		 399 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  26.67 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  26.11 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  26.17 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  24.32 
 
 		 360 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  26.24 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  32.92 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  26.35 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  27.49 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  26.35 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  25.6 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  25.36 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  24.62 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  26.89 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  31.16 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  27.19 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  25.14 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  27.64 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  24.16 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  30.99 
 
 		 352 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  33.18 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.25 
 
 		 458 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  26.81 
 
 		 359 aa  90.1  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0251  DNA-directed DNA polymerase  31.6 
 
 		 352 aa  89.7  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>