More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1154 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 417 aa  866    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  56.4 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  49.03 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  48.76 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 		 411 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  39.39 
 
 		 413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  35.52 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.56 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.06 
 
 		 413 aa  245  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  36.88 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.82 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  33.08 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.65 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  32.35 
 
 		 423 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  32.73 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.59 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  32.66 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  32.99 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  31.36 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  33.43 
 
 		 414 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  31.47 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  32.82 
 
 		 409 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  31.65 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  31.65 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  31.65 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  31.65 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  31.65 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  31.27 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  32.82 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  31.65 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  31.22 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  31.17 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  33.33 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  31.22 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  30.96 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  32.28 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  33.33 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  30.71 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  31.34 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  30.61 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  33.17 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  29.7 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  32.07 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  31.04 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  30.38 
 
 		 390 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  29.68 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  30.81 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  30.53 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  29.47 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  31.15 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  29.08 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  29.61 
 
 		 417 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  29.8 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.77 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  27.32 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  29.05 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  30.46 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  29.9 
 
 		 404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  29.7 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  30.15 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  27.92 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  29.74 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.44 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  28.82 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  32.19 
 
 		 356 aa  163  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 426 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  31.41 
 
 		 363 aa  163  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  28.12 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  28.12 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  29.53 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.08 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  29.37 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  27.39 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  29.86 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  27.39 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  29.58 
 
 		 440 aa  160  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  27.37 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  28.14 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  28.35 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  30.37 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  28.68 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  26.6 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  27.11 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  26.87 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  28.13 
 
 		 384 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  28.07 
 
 		 406 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  32.09 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  27.96 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  28.35 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  28.86 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  26.46 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  28.78 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>