More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1455 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  100 
 
 		 439 aa  915    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  48.17 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  49.77 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  47.26 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  40 
 
 		 471 aa  315  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  37.66 
 
 		 471 aa  306  6e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  37.41 
 
 		 419 aa  292  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  36.03 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  35.24 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  35.63 
 
 		 421 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  35.17 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  34.71 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  34.71 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  34.48 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  34.25 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  35.17 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  35.17 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  34.63 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  33.64 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.84 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.7 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.51 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  29.18 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  27.95 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.36 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  31.57 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  29.54 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  29.17 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  27.61 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  26.08 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.63 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  28.61 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  27.34 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  28.13 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  28.33 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  25.48 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  27.66 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  27.94 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  27.56 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  25.84 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  25.6 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  25.84 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  26.83 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  26.01 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  27.5 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  25.78 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  25.78 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  25.78 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  25.78 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  25.78 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  27.29 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  26.16 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  24.94 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  25.18 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  27.4 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  24.76 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  26.68 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  25.68 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  28.42 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  25.65 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.21 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.2 
 
 		 407 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  26.56 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  27.64 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  28.14 
 
 		 364 aa  107  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  25.65 
 
 		 410 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  25.28 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  25.3 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.26 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  27.68 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  24.28 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  28.37 
 
 		 421 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  26.84 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  24.27 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  25.58 
 
 		 371 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  26.48 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.26 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  25.18 
 
 		 448 aa  96.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  23.39 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  24.47 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  26.62 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  25.76 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  24.59 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  26.88 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  25.12 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  29.62 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  23.73 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  24.66 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  29.62 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  29.62 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  29.62 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  24.31 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  23.21 
 
 		 425 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  29.62 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  29.3 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  25 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  29.3 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  24.29 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  29.3 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>