More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1425 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  84.52 
 
 		 420 aa  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 420 aa  876    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 420 aa  876    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  50.12 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  50.59 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  50.12 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  51.31 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  50.12 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  48.93 
 
 		 421 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  49.88 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  50.59 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  40.43 
 
 		 419 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  39.72 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.27 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.17 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.33 
 
 		 425 aa  242  9e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.04 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.31 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  32.32 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  33.26 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.32 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.95 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  29.84 
 
 		 507 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  33.17 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.6 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  28.17 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  33.89 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  30.46 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  30.02 
 
 		 488 aa  169  6e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  31.59 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  29.68 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  32.23 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  29.11 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  31.87 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  30.51 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  29.06 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  31.65 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  28.82 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  30.81 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.54 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  31.66 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.27 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  28.97 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  29.69 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  28.21 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  28.21 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  28.21 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  28.21 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  27.32 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  27.89 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  27.96 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  28.03 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  28.14 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  27.14 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  29.35 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.3 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  32.58 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  27.71 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  27.48 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  26.43 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  26.93 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  27.39 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.63 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  26.6 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  26.8 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  24.75 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  26.7 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  27.16 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  25.69 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 		 422 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  26.57 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  25.99 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  27.16 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  26.82 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  25.37 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  27.35 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  25.31 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  25.51 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  27.62 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  26.82 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  25.52 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  27.02 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  25.31 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  28.36 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  25.69 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  25.06 
 
 		 417 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  24.56 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  23.6 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  26.67 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  26.91 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  25.51 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  25 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  26.89 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  24.94 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>