More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0282 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
421 aa  865    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  56.4 
 
 
417 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  46.43 
 
 
432 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  46.84 
 
 
400 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.28 
 
 
399 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.18 
 
 
413 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  35.62 
 
 
395 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  35.41 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  36.57 
 
 
414 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  33.75 
 
 
400 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  36.03 
 
 
448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  35.88 
 
 
413 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  34.01 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  36.29 
 
 
414 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.02 
 
 
432 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  32.77 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  31.54 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 
408 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  30.81 
 
 
395 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  32.07 
 
 
393 aa  189  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  29.64 
 
 
410 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  32.33 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  30.96 
 
 
420 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  30.73 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.78 
 
 
409 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  29.59 
 
 
385 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  30.85 
 
 
410 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  29.5 
 
 
409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.73 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  30.36 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  31.59 
 
 
385 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  32.39 
 
 
409 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  30.67 
 
 
409 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  32.41 
 
 
407 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  30.52 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  30.05 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.17 
 
 
407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  31.16 
 
 
418 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.1 
 
 
415 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  30.63 
 
 
412 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  30.63 
 
 
412 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  30.63 
 
 
412 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  30.63 
 
 
412 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  30.63 
 
 
412 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  31.84 
 
 
409 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  30.63 
 
 
412 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  30.63 
 
 
412 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  29.49 
 
 
430 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  31.56 
 
 
481 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  30.38 
 
 
412 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  30.81 
 
 
384 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  32.13 
 
 
354 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  29.75 
 
 
409 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  27.93 
 
 
406 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  29.29 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  29.8 
 
 
390 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  29.83 
 
 
419 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  31.86 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  30.13 
 
 
412 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  30.98 
 
 
399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  30.1 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  29.67 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  30.18 
 
 
390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  31.03 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  29.46 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  31.03 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  31.3 
 
 
418 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  29.9 
 
 
429 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  29.34 
 
 
419 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  31.03 
 
 
418 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  29.72 
 
 
422 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  29.87 
 
 
412 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  30.88 
 
 
385 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  27.51 
 
 
408 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  29.49 
 
 
431 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  28.83 
 
 
385 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  29.62 
 
 
412 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 
426 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  27.02 
 
 
402 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  27.46 
 
 
425 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  29.2 
 
 
391 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  31.32 
 
 
356 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  29.47 
 
 
408 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  28.3 
 
 
368 aa  156  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  28.75 
 
 
412 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  31.32 
 
 
378 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 
425 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  27.66 
 
 
408 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  30.59 
 
 
389 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  28.96 
 
 
371 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 
363 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  27.76 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  29.92 
 
 
435 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  32.26 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  32.26 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  29.01 
 
 
429 aa  153  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  27.76 
 
 
415 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  28.71 
 
 
405 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>