More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1339 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  73.67 
 
 		 471 aa  715    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  100 
 
 		 471 aa  975    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  38.81 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  38.38 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  37.66 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  33.84 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  34.49 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  34.06 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  34.49 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  34.49 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.07 
 
 		 420 aa  256  9e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  34.06 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  33.19 
 
 		 421 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  33.19 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  31.39 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  32.32 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  32.32 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  33.05 
 
 		 417 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  32.32 
 
 		 420 aa  229  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.58 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.15 
 
 		 447 aa  199  7.999999999999999e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.85 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  30.77 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  27.99 
 
 		 507 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  29.6 
 
 		 395 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  29.56 
 
 		 488 aa  160  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.91 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  26.94 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  27.36 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  30.27 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  27.29 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  28.8 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  29.78 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  27.47 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  27.25 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  28.73 
 
 		 432 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.96 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  26.44 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  26.33 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  25.28 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  27.29 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  25.4 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  29.75 
 
 		 421 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  26.58 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  26.46 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  26.35 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  25.81 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  27.41 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  25.99 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  25.67 
 
 		 409 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  24.04 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  23.41 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  25.94 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  26.52 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  25.18 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  25.74 
 
 		 410 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  26.07 
 
 		 422 aa  93.2  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  31.3 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  31.3 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  24.45 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.6 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  26.84 
 
 		 432 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  25.88 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  27.83 
 
 		 408 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  26.47 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  23.98 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  27.61 
 
 		 416 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  23.91 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  25.97 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  24.03 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  25.17 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  24.59 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  24.8 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  25.22 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  23.25 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  25.6 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  26.18 
 
 		 429 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  25.52 
 
 		 430 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.34 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  24.51 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  23.37 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  24.86 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.11 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  24.5 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  24.42 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  23.41 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  24.77 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  25.15 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  22.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  22.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  22.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  22.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  22.65 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  25.48 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  24.25 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  25.87 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  25.22 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>