More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1270 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  100 
 
 		 471 aa  975    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  73.67 
 
 		 471 aa  733    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  39.7 
 
 		 440 aa  335  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  40 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  40.34 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.62 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  35.42 
 
 		 421 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  34.57 
 
 		 421 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  34.57 
 
 		 421 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  34.57 
 
 		 421 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  34.34 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  34.35 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  34.56 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  33.48 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  31.82 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  32.6 
 
 		 420 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  32.6 
 
 		 420 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  32.47 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  33.19 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.14 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.96 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  29.52 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.25 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  27.63 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.84 
 
 		 399 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  29.08 
 
 		 488 aa  143  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  27.08 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  27.85 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  28.05 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  27.29 
 
 		 413 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  29.76 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  27.48 
 
 		 411 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  27.33 
 
 		 400 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  26.44 
 
 		 418 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.71 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  26.23 
 
 		 529 aa  123  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  26.53 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  26.33 
 
 		 414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  29.25 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  24.5 
 
 		 399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  25.8 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  28.66 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  24.38 
 
 		 399 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  27.73 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  28.06 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  26.41 
 
 		 414 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  30.51 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  25.07 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  25.66 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.93 
 
 		 393 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  24.49 
 
 		 412 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  25.51 
 
 		 404 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  25.35 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  26.39 
 
 		 448 aa  96.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  24.78 
 
 		 412 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  28.07 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  24.78 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  24.78 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  27.11 
 
 		 409 aa  95.1  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.41 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  27.41 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  24.88 
 
 		 380 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.33 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.06 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.37 
 
 		 415 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  25.71 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  27.05 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  24.49 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  27.13 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  24.88 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  26.19 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  27.56 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  24.4 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  24.94 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  26.67 
 
 		 353 aa  86.7  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  27.67 
 
 		 385 aa  86.7  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  25 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  24.86 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  24.04 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  25 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  24.35 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  24.7 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  26.35 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  22.89 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  25.49 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  26.24 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3247  DNA-directed DNA polymerase  22.88 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  23.54 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  26.89 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0418  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  24.43 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  24.71 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  23.19 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  23.79 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  24.83 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>