More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1465 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  100 
 
 		 443 aa  912    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  46.03 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  49.44 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  46.17 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  42.66 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  39.22 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  39.7 
 
 		 529 aa  336  5.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  37.4 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  33.41 
 
 		 424 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  32.88 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  32.73 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  31.69 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  31.15 
 
 		 421 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  31.15 
 
 		 421 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  30.93 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  32.05 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  28.86 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  31 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  27.95 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  27.95 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  30.41 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  30.47 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  29.85 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  28.51 
 
 		 439 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  31 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  27.25 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  23.72 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  23.88 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  26.44 
 
 		 395 aa  90.5  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  26.7 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  27.81 
 
 		 371 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  26.37 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  24.67 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  22.99 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  26.57 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  24.94 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  21.9 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  29.22 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  29.22 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  24.08 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  26.57 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  26.22 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  26.71 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  24.92 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  26.12 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  25.25 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  21.15 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  23.68 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  23.68 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  23.68 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.58 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  23.68 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  28.87 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  23.68 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  23.68 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  25.19 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  27.24 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3025  DNA-directed DNA polymerase  25.87 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.0754009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  27.63 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  23.9 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  28.7 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  27.59 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  28.66 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  25.82 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  26.9 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  26.9 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  27.05 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  25.32 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.08 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  23.6 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  26.9 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  28.5 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  30.84 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  27.78 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  28.16 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  25.25 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  26.92 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  25.99 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  20.14 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  27.08 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.67 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  27.08 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  25.66 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  28.28 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  25.33 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  28.28 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  23.84 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  23.4 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  28.28 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  25.63 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  29.87 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  28.46 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  30.95 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.07 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  25.9 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  24.52 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  24 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  28.69 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  26.22 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>