More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1094 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  77.73 
 
 		 440 aa  731    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  100 
 
 		 440 aa  915    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  50.23 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  47.26 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  38.38 
 
 		 471 aa  316  4e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  40.34 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  37.06 
 
 		 421 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  36.15 
 
 		 421 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  35.05 
 
 		 421 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  34.98 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  36.19 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  36.19 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  35.96 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  34.5 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  34.72 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  34.97 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  34.17 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  31 
 
 		 443 aa  210  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  33.1 
 
 		 395 aa  194  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.04 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  30.66 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  31.71 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  26.95 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.81 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  27.52 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  27.71 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  27.48 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  27.79 
 
 		 411 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 395 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  28.26 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  27.5 
 
 		 529 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  27.09 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  27.49 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  27.16 
 
 		 488 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  27.32 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  27.38 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  27.5 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  26.71 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  26.95 
 
 		 413 aa  120  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  27.25 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  27.66 
 
 		 409 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  27.16 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  27.12 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.03 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  28.75 
 
 		 450 aa  116  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.94 
 
 		 393 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  27.03 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  28.34 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  26.28 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  29.1 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  28.29 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  27.61 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  29.18 
 
 		 413 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  27.93 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  25.79 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  27.3 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  25.61 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  25.61 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  25.61 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  25.61 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  25.61 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  23.83 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  29.18 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  25.74 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  24.24 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  25.61 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  27.99 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  27 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  25.56 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  25.36 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.21 
 
 		 432 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.57 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  27.23 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  27.85 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  27.08 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  27.16 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  27.25 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  26.78 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.62 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  27.23 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  28.4 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  23.82 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  26.53 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  29.26 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  30.77 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  25.75 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  28.36 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  30.16 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.5 
 
 		 415 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.68 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  26.97 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  25.8 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>