More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1966 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
446 aa  932    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  48.82 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  44.1 
 
 
423 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  43.36 
 
 
426 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  43.06 
 
 
426 aa  361  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  42.72 
 
 
424 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  41.71 
 
 
422 aa  353  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  41.69 
 
 
425 aa  350  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.57 
 
 
419 aa  349  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 
423 aa  349  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  40.95 
 
 
421 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  41.23 
 
 
422 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  40.76 
 
 
422 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  40.76 
 
 
422 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 
422 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  40.76 
 
 
422 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  40.76 
 
 
422 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  40.76 
 
 
422 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  40.52 
 
 
422 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  40.52 
 
 
422 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  40.38 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  40.76 
 
 
422 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  42.07 
 
 
450 aa  326  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  40.52 
 
 
422 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  40.76 
 
 
422 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 
418 aa  323  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  39.34 
 
 
422 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 
437 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  40.19 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 
426 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 
424 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  38.81 
 
 
497 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  39.1 
 
 
424 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  38.39 
 
 
420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1200  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 
432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  39.23 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 
424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  36.97 
 
 
426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  38.06 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  39.43 
 
 
423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  37.47 
 
 
425 aa  302  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  38.63 
 
 
424 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  37.7 
 
 
426 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  37.47 
 
 
425 aa  299  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 
449 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  38.39 
 
 
432 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  37.29 
 
 
426 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  36.65 
 
 
492 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  37.68 
 
 
427 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  37.71 
 
 
424 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  37.83 
 
 
424 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  39.81 
 
 
420 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1178  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 
424 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0736762  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  38.25 
 
 
432 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  38.39 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  36.77 
 
 
423 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  37.29 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  35.54 
 
 
450 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  37.05 
 
 
430 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  38.48 
 
 
418 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  38 
 
 
418 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
418 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  38.33 
 
 
439 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  35.53 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  35.22 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  36 
 
 
424 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 
418 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  35.46 
 
 
418 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  35.75 
 
 
418 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  35.66 
 
 
443 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.96 
 
 
442 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10201  putative UmuC protein  36.58 
 
 
430 aa  266  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.31245  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  35.07 
 
 
418 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  34.52 
 
 
418 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  36.17 
 
 
418 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  34.91 
 
 
418 aa  263  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 
418 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 
418 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  34.52 
 
 
418 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  35.43 
 
 
478 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 
418 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09231  putative UmuC protein  35.45 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0862  DNA-directed DNA polymerase  36 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.826564  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 
418 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  35.98 
 
 
442 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09211  putative UmuC protein  34.98 
 
 
428 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  35.76 
 
 
419 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 
418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  34.45 
 
 
421 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  34.6 
 
 
418 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  33.96 
 
 
418 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  33.96 
 
 
418 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  33.96 
 
 
418 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  34.52 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  33.17 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  35.05 
 
 
426 aa  242  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  33.64 
 
 
437 aa  239  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  32.87 
 
 
428 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>