More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0794 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  100 
 
 		 420 aa  857    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  50.23 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  49.77 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  48.59 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  35.62 
 
 		 471 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  33.57 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  36.36 
 
 		 421 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  34.07 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  36.52 
 
 		 421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  36.21 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  36.21 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  35.42 
 
 		 421 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  36.06 
 
 		 421 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  35.82 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  35.58 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  35.58 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.59 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  34.53 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.47 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  32.07 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.18 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  27.07 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  28.29 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  27.57 
 
 		 500 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  27.13 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  28.68 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  28.4 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  28.83 
 
 		 488 aa  146  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  27.36 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  27 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  30.72 
 
 		 529 aa  135  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  28.88 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  29.1 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.81 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  26.79 
 
 		 409 aa  129  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  26.58 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  25.89 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  29.26 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.38 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  27.36 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.29 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  27.08 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  28.73 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  26.68 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  26.68 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  26.82 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  27.11 
 
 		 413 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  26.88 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  26.43 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  27.48 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  26.68 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  25.85 
 
 		 448 aa  116  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  27.23 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.93 
 
 		 407 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  27.23 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  27.23 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  27.23 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  27.23 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  26.18 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  26.18 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  26.21 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  26.01 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.7 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  24.55 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  25.94 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  26.29 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  23.49 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  29.7 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  26.6 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  24.49 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  27.55 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  26.17 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  21.73 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  25.53 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  27.96 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  23.46 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  23.88 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  26.35 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  24.3 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  25.92 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  25.55 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  29.5 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  22.71 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  29.68 
 
 		 353 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  24.8 
 
 		 368 aa  96.3  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.67 
 
 		 442 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  26.01 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  23.72 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  24.63 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  26.88 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  21.86 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  22.55 
 
 		 431 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  25.67 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  28.92 
 
 		 352 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  28.37 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  24.26 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  28 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>