More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1329 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 421 aa  855    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  46.03 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.31 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  41.94 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  38.45 
 
 		 507 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  38.68 
 
 		 488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  33.8 
 
 		 500 aa  301  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  32.57 
 
 		 529 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  34.62 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  33.17 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  33.41 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  32.93 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  32.45 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  32.93 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  32.69 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  32.78 
 
 		 420 aa  222  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  32.15 
 
 		 421 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  30.75 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  30.77 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  30.66 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  32.07 
 
 		 420 aa  179  9e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  30.94 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  29.52 
 
 		 471 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  29.18 
 
 		 439 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  28.09 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  25.55 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  22.96 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  22.95 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  22.51 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  23.39 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  23.43 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  22.42 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  23.22 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  23.21 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  23.08 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.42 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  24 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  23.4 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.17 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  23.57 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  23.1 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  22.86 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  22.86 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  22.86 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  22.86 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  22.86 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  23.7 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  29.96 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  21.98 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3247  DNA-directed DNA polymerase  23.49 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  24.93 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  21.74 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  23.4 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  25.12 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  23.4 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  21.58 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl328  DNA polymerase IV (PolIV)  24.28 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.9387500000000003e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  24.45 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  27.65 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  27.78 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  21.41 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  22.61 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  21.81 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  26.43 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  24.77 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  28.45 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  23.65 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  23.02 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  23.3 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  22.11 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  27.51 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  23.3 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  28.63 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  28.99 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  28.88 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  27.74 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  27.95 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  22.78 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  26.22 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  23.51 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  28.88 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  23.6 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  22.73 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf186  Pol_IV_kappa DNA polymerase  24.72 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0102913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  22.29 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  21.98 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  25.98 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  22.28 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  21.77 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  27.85 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  20.88 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  25.33 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  22.12 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  21.29 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  25.6 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  22.92 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.76 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>