More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0974 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  100 
 
 		 440 aa  918    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  77.73 
 
 		 440 aa  731    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  48.17 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  48.59 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  38.81 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  39.7 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  36.21 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  36.62 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  36.21 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  36.21 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  35.05 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  35.21 
 
 		 421 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  35.98 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  34.95 
 
 		 419 aa  256  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  34.35 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  34.81 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 417 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.49 
 
 		 447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.41 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.48 
 
 		 425 aa  203  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  30.75 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  32.78 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  32.26 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.83 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  29.58 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  30.12 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  28.12 
 
 		 400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  29.35 
 
 		 411 aa  156  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  27.34 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  26.27 
 
 		 507 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  29.31 
 
 		 395 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 		 413 aa  150  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  29.35 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  26.93 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  28.51 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.98 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  28.46 
 
 		 500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  27.03 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  27 
 
 		 529 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  27.73 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  28.26 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  28.88 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  27.25 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  27.45 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  26.25 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  26.25 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  28.6 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  27.07 
 
 		 409 aa  126  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  25.5 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  25.5 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  25.5 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  25.5 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  25.81 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  25.5 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  25.5 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  25.25 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  27.52 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.42 
 
 		 432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  28.24 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  25.81 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  25.48 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.76 
 
 		 393 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  25.94 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  29.25 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.6 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  26.63 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  25.94 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  26.05 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  25.19 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 444 aa  110  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  25.31 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  24.94 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  26.65 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  29.56 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  26.55 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  23.94 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  26.13 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  27.52 
 
 		 424 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  26.23 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  22.76 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  26.59 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  26.78 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  26.11 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  27.83 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  31.33 
 
 		 410 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  26.24 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  26.62 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  26.37 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  26.88 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  26.37 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  25 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  26.28 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  27.36 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.66 
 
 		 442 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  26.25 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  28.94 
 
 		 443 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  25.13 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  26.25 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>