More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1021 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  100 
 
 		 401 aa  783    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  66.17 
 
 		 413 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  64.74 
 
 		 407 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  66.25 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  66.33 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  66.33 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  62.63 
 
 		 402 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  65.83 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  62.12 
 
 		 419 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  57.83 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0380  DNA-directed DNA polymerase  55.39 
 
 		 358 aa  318  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154021  decreased coverage  0.00759765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  48.72 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  46.65 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.41 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  44.71 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  44.42 
 
 		 415 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.81 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.93 
 
 		 420 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  43.31 
 
 		 418 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 425 aa  245  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  41.71 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  41.9 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40.98 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.23 
 
 		 415 aa  242  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  42.44 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  46.08 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  45.24 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.8 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.4 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  40.93 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 378 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 378 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.08 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  37.17 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.15 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  34.9 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  36.42 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  38.54 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  39.85 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  43.36 
 
 		 406 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.87 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.66 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  41.03 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  38.33 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  38.24 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  39.88 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  35.9 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  32.82 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  39.28 
 
 		 395 aa  216  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  35.49 
 
 		 369 aa  215  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  40.15 
 
 		 431 aa  215  9e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  35.7 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  35.57 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  34.63 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  37.83 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  35.43 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  34.8 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  37.61 
 
 		 375 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  34.88 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  38.22 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  38.72 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  34.4 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  33.72 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  38.42 
 
 		 359 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.02 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  36.02 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  37.89 
 
 		 834 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  35.65 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  35.65 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  34.65 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  34.79 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  34.79 
 
 		 359 aa  206  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  35.63 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  34.79 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.71 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  35.78 
 
 		 365 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.71 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  37.06 
 
 		 378 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  34.39 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.77 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  36.23 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  34.71 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  33.81 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  36.36 
 
 		 355 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  34 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  36.88 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  38.16 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>