More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0380 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0380  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 358 aa  676    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154021  decreased coverage  0.00759765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  56 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  57.71 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  56.29 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  58 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  58 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  54.44 
 
 		 407 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  55.39 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  52.14 
 
 		 419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  51.15 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  50.86 
 
 		 405 aa  294  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  45.79 
 
 		 421 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  44.22 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  44.22 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  46.69 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  41.69 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  45.87 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.57 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  43.25 
 
 		 409 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  41.16 
 
 		 399 aa  225  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  43.02 
 
 		 374 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  45.91 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.91 
 
 		 418 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.81 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  41.67 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.79 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  33.71 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  43.02 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 834 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  45.15 
 
 		 419 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  44.16 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.82 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.38 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  36.16 
 
 		 363 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.49 
 
 		 408 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  32.56 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  40.79 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  38.92 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  44.2 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  34.97 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.24 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  41.19 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 		 415 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  32.96 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  38.66 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  39.08 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.82 
 
 		 412 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  34.09 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  41.64 
 
 		 463 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.66 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  39.66 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  31.96 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  35.88 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  42.33 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  40.11 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  33.24 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.62 
 
 		 489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  33.81 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  38.62 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  43.79 
 
 		 407 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  40.31 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  32.85 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.75 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.31 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  31.34 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  38.64 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.29 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.79 
 
 		 408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  34.75 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  40.4 
 
 		 430 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  41.41 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  42.05 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  38.75 
 
 		 422 aa  195  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  32.36 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  39.38 
 
 		 417 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  36.6 
 
 		 371 aa  192  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.5 
 
 		 458 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  39.38 
 
 		 449 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.92 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  39.51 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  36.45 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  32.94 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  30.06 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  43.28 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.51 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>