207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4054 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  100 
 
 		 526 aa  1021    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.72 
 
 		 495 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  26.54 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  26.17 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  27.13 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  25.56 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  25.99 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  24.22 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  28.88 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  27.26 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  27.26 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  27.26 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  26.8 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  28.27 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  26.5 
 
 		 552 aa  70.1  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  26.91 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  24.65 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  27.03 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.45 
 
 		 473 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  21.65 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  25.95 
 
 		 392 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  27.24 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  29.25 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.44 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  23.9 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  28.72 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  28.72 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  28.72 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  24.4 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  28.57 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  20.55 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  28.37 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  28.37 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  28.37 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  29.28 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  23.05 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  25.55 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  24.76 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  27.12 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  27.12 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  27.59 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  27 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  29.39 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  24.57 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  32.64 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  35.16 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  28.05 
 
 		 528 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  26.82 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  23.99 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  24.32 
 
 		 520 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  23.99 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  25.2 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  24.85 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  26.96 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  23.78 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  24.93 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  29.41 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  23.14 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  32.87 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  25.51 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  28.89 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  30.08 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  23.73 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  29.23 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  30.08 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  25.66 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  32.87 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  24.93 
 
 		 478 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  27.84 
 
 		 468 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  25.76 
 
 		 385 aa  57  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  27.83 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  28.38 
 
 		 463 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  27.48 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  23.05 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  22.95 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  23.76 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  28.08 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  26.92 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  26.73 
 
 		 467 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1864  hypothetical protein  33.62 
 
 		 763 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  21.41 
 
 		 409 aa  54.3  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.88 
 
 		 467 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  24.42 
 
 		 471 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  29.1 
 
 		 397 aa  53.9  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.59 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  31.11 
 
 		 443 aa  53.9  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  23.32 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  19.76 
 
 		 499 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  23.92 
 
 		 488 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  24.02 
 
 		 507 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  23.57 
 
 		 536 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  22.99 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  25.82 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0517  DNA-directed DNA polymerase  23.32 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  22.38 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  20.17 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  20.37 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  28.48 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  25.99 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>