135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2827 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  81.53 
 
 		 491 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  91.37 
 
 		 498 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  80.52 
 
 		 491 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  99.79 
 
 		 483 aa  926    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  92.77 
 
 		 495 aa  830    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  956    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  81.12 
 
 		 491 aa  747    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  81.01 
 
 		 488 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  81.53 
 
 		 491 aa  748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  81.33 
 
 		 491 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  81.01 
 
 		 488 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  89.56 
 
 		 495 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  98.7 
 
 		 463 aa  881    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  92.17 
 
 		 495 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  55.86 
 
 		 489 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  53.71 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  53.65 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  55.15 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  53.8 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  54.72 
 
 		 459 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  45.11 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  45.11 
 
 		 527 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  45.71 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.87 
 
 		 527 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  45.66 
 
 		 528 aa  347  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  35.79 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  44.39 
 
 		 593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  44.5 
 
 		 589 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  38 
 
 		 479 aa  252  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  38.01 
 
 		 547 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  39.13 
 
 		 441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  38.65 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  39.83 
 
 		 466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  40.52 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  37.33 
 
 		 445 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  37.44 
 
 		 405 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  37.61 
 
 		 431 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  39.09 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  34.35 
 
 		 476 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  37.76 
 
 		 505 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  38.13 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  36.24 
 
 		 472 aa  186  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  36.21 
 
 		 449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  35.25 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  35.48 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  33.27 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  35.66 
 
 		 473 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  32.72 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  37.12 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  35.49 
 
 		 492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  34.07 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  32.46 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  31.03 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  34.41 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  31.71 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.57 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  32.64 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  32.18 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  32.18 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  32.5 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  32.37 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.38 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  27.45 
 
 		 467 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  33.62 
 
 		 467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  31.35 
 
 		 507 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  31.75 
 
 		 472 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  30.54 
 
 		 433 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  29.16 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  30.74 
 
 		 472 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.1 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  31.97 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24.7 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  31.84 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  32.85 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  28.15 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  32.38 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  29.79 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.4 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  24.95 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.32 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  29.71 
 
 		 522 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.28 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.66 
 
 		 503 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  32.74 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  29.39 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.51 
 
 		 548 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  28.9 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  27.48 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  29.05 
 
 		 525 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  29.19 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.12 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  27.02 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  28.24 
 
 		 545 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  28.72 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.47 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  28.18 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  27.7 
 
 		 472 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>