99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1864 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1864  hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1545    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2101  hypothetical protein  36.63 
 
 		 684 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  25.83 
 
 		 473 aa  94.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  23.64 
 
 		 467 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  25.08 
 
 		 484 aa  90.5  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  30.3 
 
 		 479 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.87 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.18 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  29.11 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  29.01 
 
 		 471 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  27.52 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.14 
 
 		 473 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  26.38 
 
 		 476 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  27.44 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.19 
 
 		 548 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  26.07 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  24.77 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  26.87 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  27.55 
 
 		 589 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.76 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  27.71 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.84 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  27.79 
 
 		 472 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  26.2 
 
 		 470 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  27.79 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  26.98 
 
 		 488 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  26.98 
 
 		 488 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  26.98 
 
 		 491 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  26.98 
 
 		 491 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.07 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  26.98 
 
 		 491 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  26.98 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  22.89 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  26.03 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  23.88 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  29.83 
 
 		 437 aa  60.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  28.02 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  26.05 
 
 		 491 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  29.39 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  26.58 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.7 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  25.95 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  24.22 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  35.92 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  26.1 
 
 		 440 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  27.03 
 
 		 469 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  25.81 
 
 		 472 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  27.27 
 
 		 472 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  26.98 
 
 		 534 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  27.78 
 
 		 472 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  26.95 
 
 		 536 aa  55.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  54.7  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  24.57 
 
 		 486 aa  54.7  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  28.24 
 
 		 502 aa  54.3  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  33.62 
 
 		 526 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  27.09 
 
 		 432 aa  52.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  24.66 
 
 		 528 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  31.67 
 
 		 503 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  24.75 
 
 		 489 aa  52  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  26.76 
 
 		 547 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  24.61 
 
 		 541 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  24.26 
 
 		 501 aa  51.2  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  28.92 
 
 		 505 aa  51.2  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  23.96 
 
 		 495 aa  50.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  24.23 
 
 		 527 aa  50.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  24.23 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  26.27 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  24.24 
 
 		 507 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  28.93 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  28.93 
 
 		 495 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1611  hypothetical protein  32.81 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  25.66 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  28.1 
 
 		 498 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  25.53 
 
 		 507 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  23.58 
 
 		 472 aa  48.9  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  26.27 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  28.15 
 
 		 467 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  48.5  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  21.13 
 
 		 487 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  30 
 
 		 445 aa  47.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  27.73 
 
 		 500 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  35.35 
 
 		 539 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  31.25 
 
 		 569 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  28.12 
 
 		 449 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  28.69 
 
 		 474 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  24.27 
 
 		 581 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  28.1 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  28.1 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  26.24 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  28.1 
 
 		 463 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  28.21 
 
 		 441 aa  45.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.89 
 
 		 527 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  23.24 
 
 		 519 aa  44.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  26.73 
 
 		 460 aa  44.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  24.01 
 
 		 529 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  24.79 
 
 		 522 aa  44.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  26.89 
 
 		 465 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  25.17 
 
 		 405 aa  44.3  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  25.99 
 
 		 477 aa  43.9  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>