135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4129 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  75.69 
 
 		 528 aa  708    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  100 
 
 		 527 aa  1043    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  49.9 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  49.9 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  51.76 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  45.69 
 
 		 491 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  45.69 
 
 		 491 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  45.49 
 
 		 491 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  45.49 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  45.69 
 
 		 491 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  45.49 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  43.86 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  40.64 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  40.52 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  43.49 
 
 		 495 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  42.51 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  42.19 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  41.53 
 
 		 492 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  43.86 
 
 		 495 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  42.66 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  41.73 
 
 		 486 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  42.45 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  42.66 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  42.22 
 
 		 463 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  41.45 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  37.68 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  35.98 
 
 		 589 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  35.24 
 
 		 593 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  38.72 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  36.73 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  36.38 
 
 		 547 aa  220  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  38.12 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  35.58 
 
 		 392 aa  210  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  199  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  34.71 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  35.14 
 
 		 431 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  33.26 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  35.65 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  33.91 
 
 		 443 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  34.82 
 
 		 469 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  34.61 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  38.15 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  37.72 
 
 		 467 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  31.5 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.75 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  35.58 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.92 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  30.62 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  33.96 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  30.37 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.56 
 
 		 473 aa  153  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  31.74 
 
 		 505 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  31.89 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  29.6 
 
 		 473 aa  143  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  33.67 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  33.67 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  34 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  30.89 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  33.47 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.26 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.93 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  29.96 
 
 		 476 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  32.22 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29.35 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  31.99 
 
 		 502 aa  120  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  29.1 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.96 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  25.59 
 
 		 467 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  28.71 
 
 		 474 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.17 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  29.47 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.43 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.95 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  30.3 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  29.42 
 
 		 507 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  23.9 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  28.07 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  28.54 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  29.13 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  26.9 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.11 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  24.48 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  28.09 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  26.01 
 
 		 500 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.68 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  27.39 
 
 		 525 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  28.4 
 
 		 465 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  30.13 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  27.39 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  28.4 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.27 
 
 		 472 aa  104  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  30.29 
 
 		 506 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  29.08 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.36 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  27.89 
 
 		 501 aa  103  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.9 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  28.04 
 
 		 545 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  28.06 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  28.03 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>