118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2671 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  881    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  56.79 
 
 
469 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  56.38 
 
 
469 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  48.06 
 
 
449 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  47.44 
 
 
502 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  42.49 
 
 
431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  38.28 
 
 
476 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  38.98 
 
 
445 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  39.54 
 
 
441 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  37.88 
 
 
405 aa  225  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  38.46 
 
 
392 aa  217  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  37.89 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  30.02 
 
 
506 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.37 
 
 
527 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  34.2 
 
 
491 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  33.91 
 
 
488 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  33.91 
 
 
488 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  33.91 
 
 
491 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  33.91 
 
 
491 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  33.91 
 
 
491 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  33.33 
 
 
495 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  33.12 
 
 
491 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  33.41 
 
 
498 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  34.29 
 
 
495 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  32.83 
 
 
523 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  32.45 
 
 
463 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  32.29 
 
 
527 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  32.29 
 
 
540 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  29.8 
 
 
487 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  32.45 
 
 
483 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  32.45 
 
 
498 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  32.62 
 
 
479 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  32.24 
 
 
459 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  33.99 
 
 
495 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  32.39 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  34.68 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  32.03 
 
 
492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  33.33 
 
 
528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  33.8 
 
 
486 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  30.13 
 
 
489 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  36.31 
 
 
547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  33.91 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  29.25 
 
 
589 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  32.19 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  31.36 
 
 
437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  31.4 
 
 
476 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  32.48 
 
 
593 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  34.7 
 
 
505 aa  113  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  32.1 
 
 
467 aa  113  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  32.5 
 
 
471 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  30.48 
 
 
471 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  32.15 
 
 
471 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  28.38 
 
 
432 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.88 
 
 
472 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.58 
 
 
469 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.17 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  30.2 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  30.97 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  29.62 
 
 
472 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  29.18 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  28.45 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  28.8 
 
 
483 aa  83.2  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  24.95 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  26.75 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  27.35 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  27.69 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  26.16 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  27.23 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  47.06 
 
 
193 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.82 
 
 
548 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  26.48 
 
 
507 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  28.85 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  27.67 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.43 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  31.56 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  25.32 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  27.06 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.93 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  26.34 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  28.21 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  24.23 
 
 
467 aa  67  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  28.57 
 
 
471 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  23.85 
 
 
522 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  27.12 
 
 
472 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  26.3 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  33.65 
 
 
534 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  33.65 
 
 
534 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  25.67 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  23.63 
 
 
541 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.05 
 
 
499 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  26.86 
 
 
519 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  21.47 
 
 
484 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  26.97 
 
 
474 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  27.95 
 
 
472 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  30.03 
 
 
555 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  29.38 
 
 
569 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  25.38 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  34.5 
 
 
536 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1611  hypothetical protein  28.98 
 
 
551 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>