128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01908 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1017    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  80.23 
 
 		 540 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  80.23 
 
 		 527 aa  793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  51.17 
 
 		 527 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  50.83 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  42.88 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  46.3 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  46.07 
 
 		 491 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  46.07 
 
 		 491 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  45.87 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  46.07 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  45.87 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  45.87 
 
 		 491 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  45.33 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  45.52 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  44.47 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  41.06 
 
 		 487 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  44.38 
 
 		 498 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  44.76 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  45.4 
 
 		 459 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  44.88 
 
 		 459 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  45.14 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  43.63 
 
 		 486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  44.99 
 
 		 483 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  44.38 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  32.64 
 
 		 506 aa  256  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  37.68 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  35.17 
 
 		 593 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  36.92 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  36.77 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  34.25 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  34.75 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  39.15 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  32.32 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  37.41 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  33.72 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  36.24 
 
 		 449 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  34.51 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  32.72 
 
 		 476 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  33.48 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  33.26 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  35.04 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  32.34 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  32.64 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  36.47 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  31.19 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  33.41 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  33.14 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  33.02 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  30.34 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.49 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  29.45 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.62 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  32.84 
 
 		 502 aa  127  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.06 
 
 		 472 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  27.43 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  23.54 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  30.06 
 
 		 472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  30.63 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  29.86 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  31.11 
 
 		 507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  29.41 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.31 
 
 		 499 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  27.29 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  29.58 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  30.4 
 
 		 472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.61 
 
 		 499 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  26.12 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  28.94 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  30.74 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  30.3 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.15 
 
 		 467 aa  107  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.66 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  30.27 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.81 
 
 		 452 aa  105  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  29.57 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  30.1 
 
 		 472 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  27.91 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.68 
 
 		 503 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  28.21 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.73 
 
 		 548 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  29.08 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.47 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  28.4 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.35 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  30.12 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  26.61 
 
 		 503 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  27.71 
 
 		 472 aa  93.6  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.11 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  28.11 
 
 		 474 aa  90.5  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  28.7 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  26.13 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.03 
 
 		 519 aa  87.8  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.22 
 
 		 525 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  23.4 
 
 		 541 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  28.02 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  28.11 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  27.91 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  21.79 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  27.51 
 
 		 536 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>