132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2733 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  849    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  57.68 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  56.53 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  52.96 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  52.46 
 
 		 443 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  42.73 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  39.35 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  38.23 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  39.48 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  39.48 
 
 		 488 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  39.48 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  39.48 
 
 		 488 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  37.53 
 
 		 487 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.09 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  39.48 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  39.48 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  40.43 
 
 		 491 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  40.33 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  40.09 
 
 		 495 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  39.06 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  39.86 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  38.11 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  38.71 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  35.48 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  36.83 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  32.35 
 
 		 589 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  39.62 
 
 		 483 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  39.62 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  32.11 
 
 		 506 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  36.74 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  39.13 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  40.33 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  36.83 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  35.43 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  37.11 
 
 		 528 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  35.43 
 
 		 486 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  34.13 
 
 		 527 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  34.13 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  36.92 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  34.71 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  35.76 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  35.09 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  33.49 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  33.64 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  34.96 
 
 		 472 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  35.13 
 
 		 473 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  33.49 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  32.17 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  33.09 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  31.79 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  33.87 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  31.7 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  33.26 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4902  hypothetical protein  58.77 
 
 		 193 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  31.49 
 
 		 471 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  32.79 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  30.99 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  30.93 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.75 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  30.75 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  30.75 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  31.37 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  29.78 
 
 		 472 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  30.38 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  31.99 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  27.93 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  28.38 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  29.42 
 
 		 477 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  31.17 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  30.94 
 
 		 500 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  25.5 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  26.61 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  25.06 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.4 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  29.44 
 
 		 471 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.22 
 
 		 503 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.03 
 
 		 499 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  24.03 
 
 		 541 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  29.25 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  28.82 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.39 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.84 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.66 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  28.29 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  28.44 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  27.48 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.29 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.27 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  27.07 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  25.84 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.84 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  25.5 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  23.63 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  24.95 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  25.8 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  26.34 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.01 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  24.38 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  29.46 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>