134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1533 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  890    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  44.75 
 
 		 547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  33.75 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  39.75 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  39.75 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  39.53 
 
 		 491 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  39.53 
 
 		 488 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  39.75 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  39.53 
 
 		 488 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  39.79 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.44 
 
 		 527 aa  246  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  35.84 
 
 		 487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  39.4 
 
 		 540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  39.24 
 
 		 527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  38.77 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  38.89 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  39.83 
 
 		 491 aa  240  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  39.83 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  39.41 
 
 		 498 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  38.14 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  37.14 
 
 		 489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  39.62 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  40.28 
 
 		 523 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  39.41 
 
 		 495 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  39.41 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  39.41 
 
 		 498 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  39.14 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  39.62 
 
 		 495 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  37.08 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  40.11 
 
 		 593 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  38.98 
 
 		 589 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  37.86 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  33.05 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  36.2 
 
 		 469 aa  170  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  36.42 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  37.18 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  36.5 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  39.45 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  34.32 
 
 		 392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  31.7 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  36.66 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  33.78 
 
 		 445 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  35.98 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  33.98 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  36 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  31.25 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  33.4 
 
 		 473 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  33.62 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  31.66 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  33.65 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  30.84 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  33.19 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  34.38 
 
 		 443 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  29.98 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  27.84 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.56 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  32.41 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  31.98 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.12 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  31.98 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.47 
 
 		 548 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.51 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  32.58 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  32.58 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.58 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  29.1 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  25.43 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  29.67 
 
 		 545 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  29.02 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  31.68 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  30.65 
 
 		 500 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.34 
 
 		 473 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  30.78 
 
 		 467 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  29.17 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.62 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.1 
 
 		 499 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  30.9 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  30.41 
 
 		 433 aa  97.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  29.35 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.13 
 
 		 515 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  29.07 
 
 		 507 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  29.9 
 
 		 471 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  30.87 
 
 		 502 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  29.41 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  27.13 
 
 		 552 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  26.78 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24.69 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  31.35 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.33 
 
 		 534 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  30.17 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  26.79 
 
 		 471 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  30.62 
 
 		 478 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  28.54 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.05 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  27.54 
 
 		 474 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  28.45 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  27.08 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  29.79 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>