140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2903 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  99.39 
 
 
491 aa  938    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  79.8 
 
 
498 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  93.85 
 
 
491 aa  838    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  80.12 
 
 
483 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  83.37 
 
 
495 aa  740    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  80.61 
 
 
498 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  99.8 
 
 
491 aa  942    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  942    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  99.39 
 
 
491 aa  938    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  99.18 
 
 
491 aa  936    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  942    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  80.89 
 
 
495 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  81.86 
 
 
463 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  82.93 
 
 
495 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  54.67 
 
 
489 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  53.06 
 
 
487 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  52.53 
 
 
492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  53.55 
 
 
486 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  53.43 
 
 
459 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  52.58 
 
 
459 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  44.38 
 
 
540 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  44.38 
 
 
527 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  45.8 
 
 
523 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.49 
 
 
527 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  45.18 
 
 
528 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  36.08 
 
 
506 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  44.72 
 
 
593 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  43.94 
 
 
589 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  37.65 
 
 
479 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  37.75 
 
 
547 aa  247  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  38.99 
 
 
441 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  36.45 
 
 
445 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  37.42 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  36.41 
 
 
392 aa  220  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  36.86 
 
 
405 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  38.79 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  39.21 
 
 
443 aa  203  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  35.43 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  38.61 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  36.87 
 
 
431 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  36.6 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  36.38 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  35.81 
 
 
472 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  36.64 
 
 
505 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  38.3 
 
 
437 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  32.05 
 
 
473 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  33.48 
 
 
460 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  33.64 
 
 
449 aa  170  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  35.04 
 
 
492 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  31.83 
 
 
487 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  34.47 
 
 
469 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.97 
 
 
473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  31.63 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  32.51 
 
 
471 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  30.94 
 
 
471 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  31.97 
 
 
471 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.05 
 
 
472 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  32.71 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  32.11 
 
 
472 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  32.11 
 
 
472 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.57 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24.4 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  31.09 
 
 
507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  28.15 
 
 
486 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  30.54 
 
 
472 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.35 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  32.35 
 
 
500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  32.56 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  30.3 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  29.55 
 
 
470 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  24.15 
 
 
500 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  25.41 
 
 
467 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  30.63 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  29.65 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  31.31 
 
 
478 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  27.87 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.1 
 
 
452 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  29.03 
 
 
465 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  30.58 
 
 
502 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  28.88 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.09 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  33.12 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.26 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29.23 
 
 
483 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.82 
 
 
548 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28 
 
 
473 aa  110  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.36 
 
 
467 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  26.42 
 
 
474 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  28.63 
 
 
545 aa  106  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  29.32 
 
 
525 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.95 
 
 
499 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  28.86 
 
 
477 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  29.95 
 
 
449 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  30.58 
 
 
506 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  30.36 
 
 
536 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  27.02 
 
 
474 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  27.73 
 
 
471 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.48 
 
 
472 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  26.72 
 
 
503 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  26.87 
 
 
489 aa  97.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>