146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2379 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  100 
 
 		 469 aa  922    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  56.78 
 
 		 487 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  57.84 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  55.63 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  55.14 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  54.66 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  55.08 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  54.93 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  54.72 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  54.09 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  54.87 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  55.23 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  35.28 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  39.21 
 
 		 432 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  37.21 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  41.96 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  34.95 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  34.75 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  34.95 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  34.75 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  34.75 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  34.95 
 
 		 491 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  35.02 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  34.48 
 
 		 495 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  33.12 
 
 		 492 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  30.25 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  33.69 
 
 		 495 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.15 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  32.21 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  34.96 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  29.45 
 
 		 487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  32.64 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  33.27 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.99 
 
 		 527 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  32.97 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  32.4 
 
 		 495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  32.97 
 
 		 483 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  30.84 
 
 		 540 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  30.84 
 
 		 527 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  27.25 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  32.76 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  30.39 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  31.05 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  28.11 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  33.26 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  30.84 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  31.16 
 
 		 486 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  30.62 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  29.6 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  29.07 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  31.93 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  29.57 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  33.4 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  30.96 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  29.89 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  29.52 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.96 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  29.3 
 
 		 507 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.28 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  30.27 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.33 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.59 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  32.99 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  31.37 
 
 		 500 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  29.98 
 
 		 545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  29.55 
 
 		 477 aa  130  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.26 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  31.73 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  29.19 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.67 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  31.6 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29.2 
 
 		 483 aa  126  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  32.25 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.09 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  25.42 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  29.19 
 
 		 593 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  27.39 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  29.03 
 
 		 499 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.65 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  28 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  29.88 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.1 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  27.12 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.18 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  30.47 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  30.7 
 
 		 469 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  28.18 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  25.64 
 
 		 471 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  25.95 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  27.39 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  29.32 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  28.07 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  29.77 
 
 		 466 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  32.08 
 
 		 443 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  28.79 
 
 		 536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  26.5 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  26.43 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  27.63 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  31.58 
 
 		 460 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.86 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>