132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4524 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1040    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  75.69 
 
 		 527 aa  725    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  50.64 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  50.64 
 
 		 527 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  51.11 
 
 		 523 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  45.4 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  45.4 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  45.4 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  45.03 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  45.18 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  45.18 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  42.91 
 
 		 492 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  45.49 
 
 		 495 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  40.83 
 
 		 487 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  40.82 
 
 		 489 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  45.01 
 
 		 498 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  44.13 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  45.49 
 
 		 495 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  44.51 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  45.18 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  43.4 
 
 		 486 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  43.89 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  46.8 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  46.58 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  44.23 
 
 		 495 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  36.87 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  36.06 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  37.94 
 
 		 593 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  36.98 
 
 		 445 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  38.43 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  39.14 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  36.87 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  35.24 
 
 		 392 aa  207  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  34.77 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  36.59 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  34.12 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  32.11 
 
 		 476 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  34.54 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  35.91 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  35.7 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  36.43 
 
 		 449 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  30.89 
 
 		 471 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  33.08 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  36.63 
 
 		 437 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.84 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  33.96 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  32.61 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  29.76 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  30.06 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.57 
 
 		 472 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  32.55 
 
 		 505 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  31.16 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  29.94 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  30.99 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  32.52 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  32.57 
 
 		 472 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  32.45 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.49 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  32.63 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  33.03 
 
 		 472 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  26.83 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  30.58 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  32.41 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  31.62 
 
 		 507 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  31.85 
 
 		 488 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.9 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  30.62 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.28 
 
 		 548 aa  120  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  29.08 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  25.31 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4262  hypothetical protein  33.04 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.77 
 
 		 503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.61 
 
 		 467 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  27.73 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  24.11 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  29.68 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  29 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  28.27 
 
 		 465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  30.55 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  27.24 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  29.6 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  30.02 
 
 		 472 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  27.85 
 
 		 474 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  31.44 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  30.86 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  30.27 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.73 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  30.93 
 
 		 483 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  31.89 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  29.42 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  31.84 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  29 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.46 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  29.9 
 
 		 477 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  30.94 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.82 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  29.86 
 
 		 478 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  28.57 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  31.84 
 
 		 467 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>