129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1094 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  838    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  44.67 
 
 
432 aa  282  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  40.59 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  39.58 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  39.55 
 
 
471 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  38.16 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  39.95 
 
 
467 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  38.06 
 
 
487 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  38.79 
 
 
471 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.06 
 
 
472 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  37.95 
 
 
472 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  37.95 
 
 
472 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  41.96 
 
 
469 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  37.59 
 
 
476 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  39.65 
 
 
491 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  39.65 
 
 
491 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  34.06 
 
 
473 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  39.65 
 
 
491 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  39.65 
 
 
488 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  39.65 
 
 
488 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  37.04 
 
 
487 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  39.65 
 
 
491 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  39.9 
 
 
491 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  40.25 
 
 
495 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  32.27 
 
 
506 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  35.77 
 
 
479 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  37.08 
 
 
492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  40 
 
 
495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  40.24 
 
 
495 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  35.76 
 
 
441 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  36.05 
 
 
540 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  36.05 
 
 
527 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  36.59 
 
 
492 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  36.1 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  36.78 
 
 
528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.35 
 
 
527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  36.71 
 
 
523 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  33.55 
 
 
445 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  36.27 
 
 
489 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  38.64 
 
 
498 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  38.35 
 
 
472 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  35.61 
 
 
459 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  37.81 
 
 
483 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  37.81 
 
 
498 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  36.46 
 
 
486 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  37.14 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  37.97 
 
 
466 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  33.11 
 
 
472 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  34.34 
 
 
392 aa  156  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  29.03 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  34.59 
 
 
589 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  34.95 
 
 
431 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  31.89 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  35.96 
 
 
593 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  33.92 
 
 
405 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  36.36 
 
 
505 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  30.45 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29 
 
 
499 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  32.08 
 
 
477 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  37.03 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  31.46 
 
 
488 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.9 
 
 
467 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  31.09 
 
 
477 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  33.88 
 
 
467 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  31.97 
 
 
472 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  34.35 
 
 
500 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  30.88 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  31.56 
 
 
486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  34.08 
 
 
547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30 
 
 
548 aa  133  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  34 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  31.59 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  25.74 
 
 
484 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  31.18 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  29.89 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  29.53 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  31.54 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.4 
 
 
503 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.52 
 
 
452 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  28.32 
 
 
476 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  35.46 
 
 
478 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  34.82 
 
 
506 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  28.44 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  31.62 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  29.79 
 
 
433 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  31.83 
 
 
469 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  33.65 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  29.44 
 
 
522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  28.51 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  31.81 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  30.61 
 
 
480 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  28.83 
 
 
536 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  26.14 
 
 
500 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  30.37 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  29.68 
 
 
472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  26.95 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1029  aspartate decarboxylase  26.4 
 
 
541 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  30.94 
 
 
489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  29.53 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.25 
 
 
515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.881049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>