175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2522 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  91.81 
 
 
487 aa  868    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  949    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  69.12 
 
 
473 aa  627  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  65.9 
 
 
471 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  65.97 
 
 
471 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  64.92 
 
 
471 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  64.15 
 
 
472 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  63.1 
 
 
472 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  62.89 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  63.1 
 
 
472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  55.14 
 
 
469 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  52.72 
 
 
472 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  32.24 
 
 
473 aa  203  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  37.59 
 
 
437 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  35.98 
 
 
467 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  33.96 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  31.4 
 
 
492 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  28.43 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  32.8 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  32.67 
 
 
479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  33.82 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  34.14 
 
 
459 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  34.14 
 
 
459 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  32.39 
 
 
495 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  31.78 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  31.78 
 
 
491 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  31.44 
 
 
495 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  31.78 
 
 
491 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  31.56 
 
 
488 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  31.56 
 
 
488 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  31.56 
 
 
491 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  32.88 
 
 
505 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  31.24 
 
 
491 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  30.63 
 
 
547 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  31.98 
 
 
498 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  31.98 
 
 
483 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  28.01 
 
 
467 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  31.98 
 
 
463 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  30.57 
 
 
495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  29.21 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  29.21 
 
 
540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  31.39 
 
 
498 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  29.41 
 
 
487 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  31.1 
 
 
489 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  26.61 
 
 
484 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.27 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  32.18 
 
 
441 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  29 
 
 
528 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.24 
 
 
527 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  29.25 
 
 
523 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  31.1 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  31.16 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.09 
 
 
484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  28.05 
 
 
593 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  30.08 
 
 
466 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  33.68 
 
 
478 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.54 
 
 
473 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  29.74 
 
 
431 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  29.5 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  27.95 
 
 
589 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  27.68 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  24.58 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  28.7 
 
 
469 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  27.34 
 
 
536 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  29.7 
 
 
525 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  31.95 
 
 
460 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  30.5 
 
 
469 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  29.23 
 
 
472 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  27.53 
 
 
534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.16 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.24 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  27.72 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.83 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  29.44 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  29.54 
 
 
500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  27.96 
 
 
507 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  28.92 
 
 
470 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  28.89 
 
 
483 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  28.66 
 
 
489 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  29.42 
 
 
440 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.34 
 
 
548 aa  104  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  26.41 
 
 
507 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.42 
 
 
499 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  27.22 
 
 
477 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  28.04 
 
 
472 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.6 
 
 
515 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.7 
 
 
472 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  27.75 
 
 
477 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  28 
 
 
545 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  25.78 
 
 
501 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  26.35 
 
 
486 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  27.54 
 
 
449 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  25.35 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  25.73 
 
 
474 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  27.86 
 
 
480 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  28.45 
 
 
467 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  29.79 
 
 
443 aa  94  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  26.82 
 
 
552 aa  93.6  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.62 
 
 
503 aa  93.2  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  24.74 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0759407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>