240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4575 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  90.02 
 
 		 471 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  950    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  98.72 
 
 		 467 aa  872    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  60.51 
 
 		 472 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  61.36 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  51.08 
 
 		 507 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  50.49 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  48.65 
 
 		 522 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  49.79 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  52.22 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  46.51 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  48.83 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  46.4 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  45.04 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  48.9 
 
 		 465 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  44.8 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  46.48 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  47.9 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.62 
 
 		 548 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  41.74 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  43.18 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  47.06 
 
 		 480 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  42.52 
 
 		 471 aa  319  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  42.21 
 
 		 545 aa  315  9e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.77 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  40.73 
 
 		 529 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  38.05 
 
 		 500 aa  302  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.66 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  41.95 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  42.02 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.26 
 
 		 503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  41.44 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  43.27 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  43.19 
 
 		 478 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  41.51 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  36.47 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  38.83 
 
 		 462 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  40.4 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  38.76 
 
 		 534 aa  273  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  42.14 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  38.39 
 
 		 534 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  41.27 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  38.25 
 
 		 477 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  37.79 
 
 		 472 aa  263  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  39.19 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  38.25 
 
 		 536 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  39.34 
 
 		 488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  36.55 
 
 		 552 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  40.27 
 
 		 449 aa  239  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  45.45 
 
 		 562 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.55 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  33.21 
 
 		 495 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  31.21 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  32.89 
 
 		 495 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  31.66 
 
 		 471 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  31.17 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  32.12 
 
 		 498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  32.33 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  31.93 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  31.93 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  31.74 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  31.93 
 
 		 491 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  28.96 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  31.22 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  32.35 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  32.35 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  29.05 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  32.12 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  32.98 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  31.81 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  32.77 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  30.19 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  27.81 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  31.98 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  28.86 
 
 		 527 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  28.86 
 
 		 540 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  25 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  29.46 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  30.11 
 
 		 523 aa  114  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  30.11 
 
 		 476 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  27.74 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.4 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  27.03 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  24.63 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  27.35 
 
 		 486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  27.53 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.03 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  28.6 
 
 		 445 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  31.37 
 
 		 528 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.66 
 
 		 527 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  31.02 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  29.76 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  28.21 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  28.37 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  28.37 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  30.33 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  29.59 
 
 		 593 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.17 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  32.93 
 
 		 555 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>